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lncrna数据库的数据来源都有哪些
时间：2026-07-22 09:37:02 编辑：袖梨 来源：一聚教程网
lncRNA（长非编码RNA）数据库的数据来源主要包括以下几种：
- RNA Central：整合了NCBI GenBank、European Nucleotide Archive (ENA)、DNA Data Bank of Japan (DDBJ)、RefSeq、Rfam、miRBase等多个公共数据库中的RNA序列和注释信息。此外，还包括文献报道中的RNA序列和相关信息，以及来自其他数据库的RNA序列和结构数据。
- RiceLncPedia：专门收集整理水稻（Oryza sativa）长链非编码RNA（lncRNA）的数据库，数据来源于NCBI GenBank、RAP-DB、TIGR Rice Genome Annotation Project、MSU Rice Genome Annotation Project Database、Rice Genome Resource Center等。
- LncRNADisease：可以查看lncRNA与疾病关系的数据库，数据来源包括文献报道和其他公共数据库。
- NONCODE：收集和整合了全球范围内的非编码RNA序列和注释信息，数据来源包括GENCODE、RefSeq、Ensembl和其他公共数据库。
- LNCipedia：广泛收集、注释和分类lncRNA的数据库，数据来源于公开可获得的文献和其他公共数据库，如GENCODE和Ensembl。
- LncBook：整合了GENCODE、NONCODE、CHESS、LNCipedia、FANTOM-CAT、BIGTranscriptome等10余个数据库的lncRNA数据，提供全面高质量的人类lncRNA集合和参考文件。
这些数据库通过整合不同来源的RNA序列和注释信息，为RNA生物学研究提供了一个全面而准确的资源，促进了RNA研究的发展。
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